मेकोबालामाइन के अनुसार NFI 2011 अद्यतन के अनुसार, इसके प्रमुख दुष्प्रभाव निम्नलिखित हैं: उल्टी, दस्त, चक्कर आना, त्वचा में खुजली या उज्ज्वलता, श्वसन तंत्र में समस्या, अस्वस्थता, अनिद्रा। हालांकि, यह सभी दुष्प्रभाव सभी व्यक्तियों को प्रभावित नहीं करते हैं। यदि आपको इनमें से कोई भी दुष्प्रभाव होता है, तो तत्काल अपने चिकित्सक से परामर्श करें। ध्यान दें, यह सूची सम्पूर्ण नहीं हो सकती और सभी व्यक्तियों को यह दुष्प्रभाव नहीं हो सकते।