नैटामाइसिन के उपयोग से निम्नलिखित दुष्प्रभाव हो सकते हैं: उलझन, चक्कर, बुखार, दस्त, उल्टी, खुजली, चर्म विकार, जीवनाशीलता, गर्भपात, गुर्दे की समस्याएं, भूख की कमी, अस्वस्थता, अस्थियों और संधियों में दर्द, नींद न आना, नक से खून बहना।

यदि आपको इनमें से कोई भी दुष्प्रभाव होता है, तो तत्काल अपने चिकित्सक से परामर्श करें। ध्यान दें, यह सूची सम्पूर्ण नहीं हो सकती और सभी व्यक्तियों को यह दुष्प्रभाव नहीं हो सकते।